胚胎染色体异常是引起胚胎停育或者胎儿畸形的最重要的原因之一。
如果通过染色体分析发现胚胎染色体存在异常，那么就要分析引起这种异常的原因。
第一胚胎染色体异常可能来源于夫妻双方，例如父亲或者母亲存在染色体的异常，那么形成了精子和卵子，就有可能遗传这种染色体的异常，进而形成的受精卵也会出现染色体的异常。
所以受精卵发育为胚胎以后，胚胎由于染色体的异常就会出现自然流产或胚胎停育。
第二，有些时候胚胎染色体异常时，检测夫妻双方发现夫妻双方很正常，对于这种情况主要是由于胚胎在自我发育的过程中出现了染色体的增多或者是减少，是染色体的自发性的行为，和夫妻双方没有关系，主要是由于胚胎在生长发育过程中受到外界的影响，引起的染色体物质的分配不均衡。