球孢子菌病在确诊方面，建议做实验室检查来进行分析。
这些实验室检查方面，最常见的是做血常规，判断中性粒细胞数目是否有升高以及嗜酸性粒细胞数目是否有增加。还可以做真菌检查，可以取患者的痰液或者是皮肤表面的脓液，甚至是做脊椎穿刺，取脑脊液，做真菌培养或直接真菌镜检。如果能够看到真菌，基本就可以确诊。
还可以做出球孢子菌素的皮肤试验，主要是采集皮肤表面的标本，做相关的检查，这样可以有助于诊断。有必要的也可以做皮肤病理学检查，能够看到损害呈急性化脓性反应，能够找到大量的中性粒细胞浸润以及干酪样坏死。