男性患者阴茎上长红点是多种疾病都可能会出现的临床表现，所以治疗上需要先明确具体的病因，再给予针对性治疗。
首先，细菌感染导致阴茎皮肤局部红肿是最为常见的。这时通常可以使用莫匹罗星软膏等消炎药物涂抹患处，多数患者炎症可以逐渐消退，阴茎皮肤可以逐渐恢复正常。但是有些患者病情较重时，常需要口服或者静脉使用抗生素进行消炎治疗。
其次，因为患者有冶游史或者血液接触而感染梅毒时，也可能表现为阴茎长红点。这时治疗的关键是诊断梅毒螺旋体的治疗，常采用长效青霉素肌肉注射治疗。
在治疗期间，需要禁止进行性生活。如果是这种情况，患者也不需要过于担心，梅毒是可以治愈的疾病。