轻微的输精管堵塞，可通过服用药物进行治疗，如果效果不明显可选用手术疗法。对于囊肿以及先天性因素所导致的输精管堵塞，可直接应用手术疗法。
如果输精管堵塞为炎症因素所导致，应当先提取分泌物进行检测，选用相应的抗感染药物治疗，治疗效果不明显，可考虑使用手术方法进行疏通。
如果是前列腺肿瘤或者是囊肿所引起的堵塞，应当进行手术治疗，将肿瘤或者囊肿切除，在术后输精管不再受到肿瘤或囊肿的压迫，会逐渐的通畅。
如果为先天输精管堵塞，应当考虑手术疗法，如果手术疗法效果不理想，可考虑人工授精。