治疗肾功能衰竭的药物有很多，有些药物治疗肾功能衰竭的过程中会有副作用的产生。
当然，出现的副作用有轻有重，表现比较轻的副作用，有时会随着用药时间延长，患者逐渐会适应，比如控制血压的药物中有钙离子通道阻滞剂，部分人就可以出现头痛、颜面部皮肤发红、脚踝出现水肿等。如果停用这种药物以后，由药物导致的副作用就会很快消失。
由于肾脏功能衰竭以后，很多药物的半衰期会发生改变，导致药物的副作用也会明显增多，比如常见的ACEI类药物，就容易出现高钾血症、血肌酐增高的副作用，所以需要监测肾功能的变化。