脑脓肿的治疗方法主要是对症治疗。在脓肿没有完全形成之前，应考虑应用抗生素进行治疗。抗生素的选择主要是根据细菌培养结果，选择敏感类抗生素，能够做到对症治疗，有效缓解疾病，控制病情。
患者应做到早期、足量以及足疗程应用抗生素，可促进部分脓腔治愈。在脓肿形成后，则需要考虑手术治疗。针对体积较小的脓肿，可选择穿刺引流术，将脓液排除体外，促进疾病康复。
如果脓肿体积较大，无法通过穿刺引流将脓肿全部清除，这种情况需要考虑进行脓肿切除手术，术后预后效果较好。