肝癌是常见的造成甲胎蛋白偏高的原因之一，一般正常人血清中甲胎蛋白的含量不到20μg/L，但当肝细胞发生癌变时，却又恢复了产生这种蛋白质的功能，通常以400μg/L为标准，高于此数值应该考虑肝癌的可能性，妊娠妇女和新生儿也会出现甲胎蛋白的一时性升高。
因为甲胎蛋白是胎儿的正常血浆蛋白成分，是胚胎早期的主要蛋白质，妊娠期妇女甲胎蛋白是会明显升高，甲胎蛋白偏高也可能与非恶性疾病如急慢性肝炎、重症肝炎恢复期、肝硬化、先天性胆管闭塞、畸形胎儿等疾病有关。
因此，临床上如查出甲胎蛋白含量增高，需要到医院行进一步的检查，以明确病因，避免耽误治疗。