对于肾盂输尿管连接部梗阻又叫做UPJO，对于此类疾病目前具体原因不明，一般主要有三方面原因：
一、管腔的内在因素。
二、对于输尿管腔外的外在因素。
三、是由于输尿管本身的因素。大部分患者是由于先天遗传性因素导致，也就是先天俱来，并没有什么后天性因素引起，也就是说在小孩刚出生的时候，就会有UPJO存在，只不过是随着身体的增长，在后期逐渐狭窄越来越严重，从而引起肾盂积水。对于输尿管管腔内在因素，主要是由于内部有结石或者感染导致输尿管管腔发生炎性狭窄，从而进一步加重肾与输尿管狭窄引起的梗阻，导致肾盂积水。对于输尿管管腔的外在因素主要是由于周围有粘连，比如做过腹腔镜或者后腹腔镜的手术，由于粘连性梗阻导致输尿管受到压迫，因此会引起肾盂输尿管连接处的梗阻，以及受到肾动脉或者静脉的压迫，都会导致输尿管受压从而引起梗阻，导致肾盂积水的产生，而对于输尿管本身的病变，比如输尿管本身蠕动能力较弱，因此会导致先天性的肾盂积水以及特发性又叫做原因不明性的肾盂积水。