很多种疾病都需要做腰椎穿刺这种手术来明确病因。
首先，就是一些颅内的感染性病变，比如怀疑有脑炎、病毒性脑炎、细菌感染或者是结核杆菌所导致的脑炎、脑膜炎以及脑脓肿，或者是手术以后出现的颅内感染，这种情况下都需要做腰椎穿刺的手术，抽取部分的脑脊液进行化验。在做腰穿的时候能够观察到脑脊液的压力，看看是否有压力升高。
另外，也可以观察到脑脊液的颜色，比如有些感染的时候会出现淡黄色或者是牛奶一样，或者是化脓性的。另外，化验的时候会发现脑脊液的白细胞升高。
另外，一些出血性的颅内疾病或者是颅脑的肿瘤，往往也需要做腰穿的手术。