颅骨缺损会引发头疼、头晕、脑积水，并易发生缺损区域颅脑损伤发生。
颅骨缺损引起的疾病与颅骨缺损的范围的大小、部位，以及缺损时间有关。颅骨缺损范围直径小于3cm或发生于枕部，基本上不引发疾病，不予修补治疗。
缺损范围大于3cm，会引发头疼、头晕，且缺损区域缺乏坚硬颅骨的保护，易导致缺损区域颅脑受损，引发脑出血发生。长期大面积的颅骨缺损，脑组织会发生膨出现象，引起脑室扩张，可能引发正常压力脑积水发生，并逐渐引发步态不稳、智力障碍、尿失禁。
因此，建议颅骨缺损患者在三个月后尽早行修补治疗，避免缓解上述病症的发生。