第一，吞咽困难可能是耳鼻喉疾病，比如急性喉炎、急性咽炎、扁桃体炎、急性会咽炎，由于急性会厌炎发病比较急情况特殊，在短期内会引起憋气、吞咽困难，吞咽疼痛甚至窒息危及生命，需要提起特别关注，需要做电子喉镜检查。还有可能是耳鼻喉科常见疾病如喉癌、下咽癌引起的吞咽困难，需要做电子喉镜、喉部CT、喉部核磁检查等。
第二，消化内科疾病，比如食道占位、胃癌等疾病，需要做电子胃镜确诊。
第三，脑内科疾病，比如脑神经脱髓鞘样改变、脑梗塞、脑肿瘤、老年痴呆等疾病引起。吞咽反射减弱或者是吞咽反射消失，需要做头核磁、头CT检查除外这些疾病。