新冠肺炎病毒核酸检测是新冠肺炎病毒检测的金标准。其本质是通过检测荧光信号的累积，来确定标本中是否有病毒核酸，同时进行病毒基因测序，实现新冠病毒RNA精准检测。
新冠肺炎核酸检测主要是通过采集患者咽喉部，鼻咽部以及肛门的分泌物作为标本进行检测。
但因为新冠病毒的复制有一定的间歇期，也就造成了核酸检测时存在一定程度的假阳性和假阴性，因此对于有流行病学史的人群进行核酸检测时，至少两次核酸检测阴性才可以完全排除。