动脉栓塞会导致远端组织脏器出现急性缺血的症状，比如发生在脑部可出现脑组织的急性栓塞，导致脑梗死的出现。
如果发生在心脏，会导致冠状动脉的急性栓塞等，导致出现心肌梗死、心绞痛；如果发生在内脏动脉，比如肠系膜上动脉，会导致肠道的严重缺血，引起腹痛、腹胀，甚至是出现肠道坏死的情况；如果发生在四肢的动脉，会导致远端组织出现坏疽的情况。
如果一旦发生了动脉栓塞，一定要进行及时的治疗，如果没有得到及时有效的治疗，会导致器官的功能丧失，甚至不得不通过手术摘除重要的组织或者是脏器。如果动脉手术成功，并且早期解除，有可能会出现动脉栓塞后的再灌注损伤，导致功能器官的功能出现一过性的功能丧失。而且发生在肠道的动脉栓塞，当开通动脉的时候，会导致大量的毒素进入到体内，引起全身的炎症反应、多脏器功能衰竭。