肛瘘手术后一般三、四天就可以洗澡。本身肛瘘术后切口也需要使用中药、高锰酸钾等溶液坐浴清洗，所以肛瘘手术切口并不怕沾水。
术后三、四天如果切口局部没有感染、出血等症状就可以洗澡，但应该尽量避免使用一些刺激性的沐浴露，而且洗澡的过程中，需要将手术切口内的肥皂液或者沐浴露清洗干净，并且在洗澡完成后进行切口的清洁与消毒。
可以在洗澡后使用高锰酸钾溶液，按质量1:5000与水配比坐浴，有条件的患者可以在洗澡后进行切口换药。