对于阴囊坏疽主要是进行综合治疗，也就是药物治疗加上手术治疗。
患者如果存在阴囊坏疽，必须及时使用多种有效抗生素进行联合治疗，抗阳性菌、抗阴性菌以及抗厌氧菌抗生素联合使用，同时进行创面分泌物的培养，然后再根据药敏试验及时调整抗生素。
同时，如果阴囊坏疽在泌尿外科进行住院治疗，必须及时进行清创以达到将坏死组织去除，一直到正常的筋膜为止，将坏死组织切除之后，敞开窗口进行充分的引流，否则容易导致坏疽进一步感染深部组织以及肌肉，甚至播散到大腿以及会阴部区域，导致严重的并发症产生。
同时，如果患者合并糖尿病，那么需要进行选糖尿病控制，如果在后期患者出现皮肤坏死，还需要进行植皮手术。