卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，是子宫内膜异位到卵巢皮质并在其内生长，反复周期性出血，形成单个或多个囊型的典型病变。卵巢巧克力囊肿以手术治疗为主，因术后复发率较高，故对于病情较重的患者，术后多需药物巩固治疗。
一般说来，囊肿直径＜4cm,痛经等症状不明显者，可短期随访，观察囊肿消长；囊肿直径≥4cm,建议手术治疗,以达到明确诊断、清除病灶、缓解疼痛、治疗不孕的目的。
腹腔镜是治疗卵巢巧克力囊肿最好的手术方式。因为腹腔镜下手术视野开阔，能最大限度的清除盆腔内各处的病灶（囊肿）及粘连，恢复盆腔正常解剖，同时可充分冲洗盆腔，改善盆腔内环境，故腹腔镜术对于促进患者术后恢复及治疗不孕，显著优于传统的开腹手术！术后给予药物治疗；或上曼月乐环控制等等。术后遵医嘱进行规范的药物巩固治疗及门诊随诊非常重要。