一些轻的不完全脱肛，可以用药物治疗。根据辨证施治，可以用中成药，如金匮肾气丸、补中益气丸、十全大补丸等。如果有清热，可给予除湿清热中药治疗。如有虚寒，给予温中散寒。
脱肛的治疗还可以用注射疗法，可用硬化剂，如消痔灵，行黏膜下点状注射、黏膜下柱状注射、直肠周围注射等。手术治疗是治疗脱肛的主要方法，手术分为经肛门手术和经腹部手术。
脱肛患者平时要常做提肛运动，以增强盆腔肌肉筋膜对直肠的支持和固定作用，改善肛门括约肌功能。