功能失调性子宫出血的原因有很多，比较常见的包括青春期的功血、更年期的功血、以及生育年龄的功血。
青春期功血往往是由于下丘脑垂体卵巢轴的发育还不是十分完善，对于月经的调节并不稳定，卵巢分泌的雌孕激素的水平呈现波动的现象，因此可能会出现异常的子宫出血或者是闭经的现象，一般随着年龄的逐渐增长，下丘脑垂体卵巢轴的功能逐渐完善，功血的症状会逐渐好转。
更年期功血是由于卵巢激素水平的下降，卵巢功能的下降、衰退所导致的异常子宫出血。
生育年龄的功能失调性出血往往是由一些激素的水平的波动，包括多囊卵巢综合症、高雄激素血症或者由于高催乳素血症等等，都可能会引起生育年龄的功能失调性的子宫出血，可以进行全面的检查，来查找具体的原因。