高位的肛周脓肿早期，主要表现在直肠的黏膜下会形成一个脓肿，也可在直肠后深间隙形成脓肿。高位肛周脓肿因为脓肿的位置比较高，所以一般疼痛感并不是很明显。
早期可以表现为肛门坠胀、经常想拉大便、排便不尽感。随着病情的逐渐进展，脓腔压力升高，部分细菌会进入到血液而导致出现发烧。
高位的肛周脓肿，在肛门外面一般没有比较明显的肿块。再做肛门指诊，就可触及隆起的肿物并有波动感，触摸有压痛。高位的肛周脓肿形成后要做手术进行治疗，可以选择挂线术。