颅底凹陷症又称为颅底陷入症，指的是以枕骨大孔为中心的颅底骨组织出现了内翻。
对于寰椎枢椎的齿状突等上颈椎的结构陷入颅内，从而导致颅后窝的容积缩小，枕骨大孔前后径缩短，从而产生的一系列症状和体征。其发病没有地区或者性别的差异。
多数情况下，伴发于严重的神经系统损伤出现有明确的临床症状时，要给予患者以手术治疗。影像学的诊断，多数情况下需要借助x线检查。在实际操作过程中，由于x线球管投照位置的干扰，在一定程度上影响到了检测指标的准确性。因此在诊断是否有颅底凹陷症的情况是需要全面的观察颅底、枕骨、大孔区有无明显的骨质改变，并且需要综合分析患者的症状和体征，才能对患者的病情做出明确的诊断。
目前，随着影像学技术的不断发展，头颅ct扫描和核磁扫描已经广泛的应用于颅底凹陷症的临床诊断。在矢状面二维平面图上的测量指标，可以清晰的显示下垂的脑结构和合并的其他部位的畸形。此外，对于脊髓压迫的情况也具有一定的临床价值。