做了巧克力囊肿手术后，一般要间隔3~6个月再备孕。
巧克力囊肿术后需要一段时间使卵巢功能恢复正常，使其自主排卵，形成规律的月经。由于目前对于巧克力囊肿多使用腹腔镜下手术，对子宫、卵巢以及输卵管的损伤较小，故恢复时间会缩短。如果月经周期及月经量恢复到术前的水平，就可以安排同房备孕，一般情况下需要3~6个月。
巧克力囊肿术后若恢复正常月经即可开始备孕，一般需要3~6个月，巧克力囊肿术后患者若很快受孕，也可以降低粘连及复发风险。