单纯性肾囊肿作为泌尿系统常见的良性肿瘤，大多数的肾囊肿是没有明显症状的。
因为单纯性的肾囊肿通常体积比较小、数目比较少，主要位于一侧肾脏，双侧肾脏囊肿比较少见。肾囊肿对肾脏实质没有明显的压迫作用，所以患者没有明显的腰痛。
之所以发现有肾囊肿，很多患者是因为在住院的过程中，或者因为体检做肾脏超声或者CT发现。如果肾囊肿体积大于5厘米以上，部分人可以有腰酸、腹胀的症状，而且这种症状是可以耐受的，不会出现剧烈的腰痛；如果较大的囊肿出现破裂以后，可以导致血尿和腰痛。