羊水栓塞胎儿可能会出现一些后遗症的，这个主要是和羊水栓塞发生的时间有关系。如果羊水栓塞发生在宝宝免除之后，或者是宝宝很快就生出来的情况，有的是不影响宝宝的健康的，出生时候评分很好，没有发生窒息，那就不会有后遗症的问题的。
如果羊水栓塞是发生在宝宝出生之前，也常常会因为羊水栓塞所发生的低血压情况，而影响到胎盘循环，而导致胎儿缺氧的可能。
如果是比较长时间的缺氧环境，而不能很快的分娩出宝宝，或者不能很迅速的做剖宫产手术分娩出宝宝的情况，也有的会有胎死宫内或者新生儿窒息，或者缺血、缺氧性脑病的问题发生。