甲沟炎如果引起了肉芽肿，一般在临床处理上主要是通过手术治疗。
如果肉芽肿形成并不明显，一般可以采取镊子或者是剪刀在局部麻醉下进行清除。如果形成的肉芽肿比较大，还需要进行相应的手术切除治疗，这种情况可能是甲沟炎反复发作，而造成皮肤软组织的炎症性的增生，所以造成了肉芽肿。
一旦产生肉芽肿，患者可能会形成明显的感染蔓延或者是感染的迁延现象。所以在治疗上一定要清除肉芽肿以后，再进行抗感染治疗，这样才能够保证甲沟炎的治愈。