造成吞咽困难的病因不同而造成的症状表现也会有所不同，比如较为常见的神经系统病变所引起的吞咽障碍，其中有脑出血、脑干梗塞、多发性脑梗塞，这类疾病都会因损伤主管吞咽运动神经，从而使患者出现吞咽困难、饮水呛咳。
还有运动神经元病以及重症肌无力，也可导致咀嚼肌和咽喉肌、舌肌的无力，这也会使患者出现咀嚼和吞咽困难。
而较为常见的咽喉部位病变，比如急性的扁桃体炎、急性咽炎、咽后壁脓肿等等，这类疾病造成的吞咽困难，同时还会伴有咽部的疼痛症状。如果要确诊可以做一个吞钡检查。