祛痣治疗的主要危害是选择的方法不好，容易导致祛痣之后留下比较明显的痕迹，甚至对色素痣没有经过系统的甄别，对有可能是恶性的色素痣也就是黑色素瘤，没给予很好的诊断而耽误病情，甚至可能危及生命。
色素痣本身是比较常见的皮肤表面的色素沉积，比较小的可以通过激光、电烧、冷冻的方法将其去除，比较大的、生长迅速的，一般建议通过手术的方法切除。
如果选择不当或者是在治疗之后，没有对局部积极地进行创面修复，就有可能留下非常明显的瘢痕，并且相对生长比较快速的色素痣没有进行病理检查，可能会使色素痣的恶性病变难以及时地发现。