由于b超以及ct的广泛应用，单纯性肾囊肿的发现率明显增加，大多数肾囊肿没有明显的表现，多是在住院或者在体检的过程中偶尔被发现。较小的肾囊肿可以没有任何症状，当囊肿较大时可以导致患者出现腰背部疼痛不适，但是比较少见。如果囊肿突然出血，可以引起患者急性腰痛，导致患者有血尿，尿的颜色发生改变。有些肾囊肿如果位于肾下极，并且紧贴输尿管可以引起肾盂积水，而尿液对肾盂的压迫作用，导致患者出现背痛甚至会出现急性肾盂肾炎，导致患者尿频、尿急、尿痛。个别情况下，如果囊肿压迫邻近的血管可以导致患者出现高血压。