小孩心律不齐长大后会不会自愈要看具体情况。大多数小孩子都会出现窦性心律不齐，这是一种正常的生理现象。窦性心律不齐主要跟呼吸节律有关，所以对于这种窦性心律不齐没有必要太在意，随着年龄的增长以后会逐渐自愈。
还有一些小孩子会出现偶发的早搏，也会表现为心律不齐，对这种状况可能属于生理性的没有必要去治疗，也会随着年龄的增长逐渐消失。但是如果是其他类型的心律不齐，比如房颤、二度房室传导阻滞等，就需要做相应的治疗。
所以小孩子心律不齐需要做一个心电图来检查来明确是属于哪一种类型的心律不齐，才能判断其预后。