隐匿型阴茎是属于男性先天性发育畸形，是属于局部的肉膜发育异常导致。一般通过体格检查就可以确诊，通过体检也就是阴茎体没有在体外裸露，体外只有过长的包皮。
一般隐匿阴茎常用的辅助检查可以进行局部的X光片。同时检查一下内分泌系统，也就是进行男性激素水平的测定，也可以进行阴茎海绵体造影的检查。
治疗隐匿性阴茎，临床上主要是采取手术治疗，手术治疗的原则是矫正畸形的手术。