脑积水行腰穿主要的目的是了解颅内的压力、脑脊液在椎管内是否通畅以及脑脊液的蛋白的含量。脑积水发生后，无论是保守治疗或是考虑手术治疗都需要行腰穿，其主要的目的包括以下几个方面：
第一，明确颅内的压力并行降低颅内压治疗，观察脑积水是否有好转、是否需要手术治疗。
第二，通过行腰椎穿刺，明确颅内压力的具体情况，为术中、术后确定分流器的压力及滴数提供依据。
第三，脑积水通过腰椎穿刺了解椎管内是否通畅，明确是梗阻性或交通性脑积水，进一步确定脑积水的手术治疗方式。