强直性脊柱炎和腰椎间盘突出症，两者都会出现腰部疼痛不适。强直性脊柱炎一般是休息痛。腰椎间盘突出症的腰痛一般是劳累痛，休息减轻。
所有强直性脊柱炎患者，均有不同程度的骶髂关节受累。骶髂关节炎引起的腰痛，呈隐匿性、很难定位，患者常感到臀部深处疼痛。起病多见于15～30岁的男性。
强直性脊柱炎晚期，颈椎固定性前倾，脊柱后凸，腰椎生理弯曲丧失。腰椎间盘突出症是腰腿痛最为多见的原因。患者会出现下肢相应神经支配区的感觉障碍及运动异常。