白塞病不治疗是不会自动痊愈，病情会逐步进展，会导致多系统多脏器受累级的病变，严重者可以造成死亡。
白塞病如果患者出现了眼部病变，不能够得到恰当的治疗，眼部病变就会使视力严重下降甚至失明。如果出现了胃肠道病变，可以引起溃疡出血、穿孔、吸收不良、严重感染等，都是可能造成死亡的。也可能造成中枢神经系统的病变，如果能够存活，也会遗留有严重的后遗症。
一旦诊断成立，一定要早期开始正规有效的治疗，要坚持随诊。