导致流产发生原因有很多，一般怀孕早期胚胎或者胎儿染色体异常是流产最常见的原因，还有母体原因，母体全身性疾病，如严重高热、感染、严重贫血或心力衰竭以及慢性消耗性疾病等，均可能导致流产。
再有母亲生殖器异常如子宫畸形、宫腔粘连、宫颈内口松弛等也可能导致流产，另外母亲黄体功能不全、高泌乳素血症以及甲状腺功能减退、免疫功能异常等也可导致流产。
母亲经常熬夜、酗酒以及过度紧张、焦虑、恐惧和外力创伤等也会导致流产，如果母亲过多接触放射线和有毒的化学物质，也可能导致流产。