胚胎停育是由胎儿染色体异常引起的，如果只发生一次这是自然现象，无需特殊处理。如果除了染色体异常之外，还停止了多个胚胎，将会有许多其他原因，需要找出原因。
染色体异常也称为染色体发育不全，目前已经确认了100多种类型的染色体综合征。不同染色体异常的可能性不同，可以去常规医院检查夫妻双方染色体。清除原因后，在医生的指导下及时对症治疗。
发生染色体异常时，通常会导致胎儿不育。不论精子或卵子，只要携带的遗传物质的染色体异常，即使形成受精卵，此时的胚胎通常也不会正常发育。