人感染猪流感潜伏期一般1至7天左右，较流感，禽流感潜伏期长。
(一)临床症状 人感染猪流感后的早期症状与普通人流感相似，包括发热，咳嗽，喉痛，身体疼痛，头痛，发冷和疲劳等，有些还会出现腹泻或呕吐，肌肉痛或疲倦，眼睛发红等。 部分患者病情可迅速进展，来势凶猛，突然高热，体温超过39℃，甚至继发严重肺炎，急性呼吸窘迫综合征，肺出血，胸腔积液，全血细胞减少，肾功能衰竭，败血症，休克及Reye综合征，呼吸衰竭及多器官损伤，导致死亡。
(二)体征 肺部体征常不明显，部分患者可闻及湿啰音或有肺部实变体征等。
(三)预后 人感染猪流感的预后与感染的病毒亚型有关，大多预后良好；而感染H1N1者预后较差，病死率约为6% 。