包皮过长不会导致阴茎短小。包皮是覆盖在龟头前端多余组织部分，包皮外观长短存在一定个体差异，不影响阴茎生长发育，但是容易积聚包皮垢。做好卫生护理，经常用温热水清洗处理即可。可做包皮环切手术，降低包皮炎、龟头炎患病几率。
阴茎短小跟性发育迟缓、性激素水平低下、性发育畸形、染色体等病变有关。为了排查疾病因素导致阴茎外观短小，需要就诊泌尿科或男性专科，临床专业测量阴茎外观尺寸。必要时辅助性激素化验、睾丸彩超、染色体等相关检查。