夜间肛门瘙痒，要针对不同的疾病，采取相应的治疗方法。
如果是肛门周围癣引起的瘙痒，是由于真菌感染引起，需要涂抹抗真菌的药膏，口服抗真菌的药物治疗。肛周湿疹引起的瘙痒，可以应用清热燥湿的中药坐浴，外涂炉甘石洗剂止痒治疗，也可以涂抹激素类的药膏治疗。
如果是肠道寄生虫引发的肛门瘙痒，需要口服驱虫的药物杀灭虫卵，外面涂抹一些止痒的药膏改善瘙痒。如果是肛裂引起的肛门瘙痒，可以应用高锰酸钾坐浴，外涂去腐生肌的痔疮膏治疗，伤口愈合后瘙痒自然会消失。