黄曲霉素中毒潜伏期时间不等，在通常情况下，急性中毒会在2~12个小时之内就会出现反应。
患者会出现因为急性中毒而导致的剧烈的腹痛、腹泻、恶心、呕吐、反酸、烧心、强烈的腹膜刺激症，伴随着稀便。
但是对于慢性的黄曲霉素中毒患者，通常有一定的潜伏期，这种潜伏期是在2~3周左右，患者会逐渐出现临床症状，表现为腹胀、胃部不适、周身酸胀、周身乏力、头晕、头痛、厌食、恶心、呕吐，甚至有一部分患者会有黄疸的反应，还有一部分患者会出现消化道出血，甚至昏迷等临床症状和反应。