肺泡通气低下综合征的治疗原则主要如下：
一、患者卧床休息，预防受凉感冒，积极治疗原发疾病。
二、氧疗，可以预防低氧的发生，持续低流量吸氧可降低这类患者的死亡率。
三、应用呼吸兴奋剂，包括阿米三嗪、乙酰唑胺等。
四、辅助通气，对严重的低通气患者。可以采用辅助通气的方法改善症状。常用的方法有有创机械通气和无创正压机械通气。两者各有优缺点，有创通气优点为有效的管理患者气道，可以吸出患者气道内的分泌物，但是缺点，需要行气管插管器或切开，容易并发呼吸道感染。无创正压机械通气，患者配合性较好。
五、是膈肌起搏，对于重症低通气患者是一种有效的治疗手段。
六、呼吸肌功能训练，增加呼吸肌的肌力和耐力，加强咳嗽促使分泌物排出，增强通气的能力。