高原反应和血氧含量是有一定的关系的。
在通常情况下造成高原反应的原因，就是因为人体的氧供不足、血氧饱和度下降、缺氧、氧分压过低，影响了体内的气体交换。血氧浓度下降较为明显的时候，患者因为缺氧就会造成不同程度的高原反应。在高海拔的地区因为空气稀薄，大气的氧分压下降，所以肺泡内的氧分压也会出现降低的情况。因此，患者会出现供氧不足、乏氧等明显的症状。
中枢神经系统对乏氧和血氧含量下降极为敏感，因此，在血氧饱和度不足、血氧含量下降的时候，就会出现典型的高原反应的一系列症候群。