白塞氏综合征的治疗，主要是根据患者病情来采取个体化的治疗措施，往往包括对症治疗、针对眼炎的治疗以及内脏血管炎的治疗。
比如可以针对关节炎症应用非甾体抗炎药缓解症状，如布洛芬或者美洛昔康、塞来昔布等。对于结节性红斑的患者，可以应用秋水仙碱。
另外，针对局部溃疡性病变或者比较轻的眼炎，可以应用糖皮质激素局部使用，也可以应用沙利度胺进行治疗。对于系统脏器的血管炎，则需要大剂量糖皮质激素，联合免疫抑制剂共同治疗。有动脉瘤者应结合临床而予以切除。