真菌性食物中毒，通常是指含有真菌的食物，例如食物霉变、变质，被人食用，导致了人出现中毒，统称为真菌性食物中毒。
近些年，根据循证医学表明，真菌性食物中毒，有很多是属于急性中毒，还有很多是属于慢性中毒。其中蘑菇中毒，尤其是毒蘑菇中毒，是属于典型的真菌性食物中毒的一种。
除此之外，例如一些发霉的花生、玉米、谷物、大豆，这些物质中含有黄曲霉和黄曲霉菌，也容易导致真菌性食物中毒。另外，黑斑病菌和黑色葡萄穗状霉菌也会出现真菌性食物中毒。