贝克痣的主要危害是导致身体皮肤表面出现一些黄色，或者褐色的色素沉着性改变，并且会出现一些毛囊性的丘疹。
这种疾病常规状态下对人体的损害比较小，不会造成非常明显的影响。但是个别人可能会出现轻度的瘙痒，可能会导致病变部位出现毛发增多等现象。如果免疫力较低或者外界频繁刺激，有可能会导致立毛肌平滑肌瘤，会引发患病部位的立毛肌肉膜出现一种良性的肿瘤，这种情况会引发局部出现增生。
除此之外，也有可能会引发人体的其他皮肤表面出现一些表皮痣样的变化，但是并不会对人体的生命造成过多影响。