颅咽管瘤的复发率比较高，有些患者的复发率可以达到30%左右。
颅咽管瘤可以累及体内的多个部位，肿瘤早期没有明显的症状，所以不能及时的诊断。而且肿瘤和周围组织的联系比较密切，手术时无法完整的切除，就会导致患者的肿瘤复发的风险比较高。
肿瘤复发的风险还和肿瘤的部位有关，比如脑室內型的颅咽管瘤就容易复发。颅咽管瘤的复发几率还和医生的手术水平有关，有些医生手术水平高，可以将肿瘤完全切除，复发的风险就低。