多囊肝多囊肾是一种显性遗传性的疾病，在现有的医疗技术水平下，多囊肝、多囊肾是不可以完全治好的。只能采取相应的对症治疗措施，缓解患者出现的各种症状。
无论是肝脏上的囊肿，还是肾脏上的囊肿，随着时间的延长，囊肿的体积和数目都会发生变化，引起患者出现各种症状，比如腹痛、腹胀、腰痛、血尿等。一般主要是采取内科药物治疗的方法，比如控制血压、控制尿蛋白、控制感染、止血、止痛等。
如果肝脏囊肿或者肾脏囊肿明显增大，可以采用介入手术治疗，抽取囊液，使囊肿缩小。一旦进入尿毒症期，患者需要终身透析治疗。