早晨有黄痰考虑是上呼吸道感染引起，首先要考虑咽喉炎、扁桃体炎、鼻炎、鼻窦炎等。由于晚上睡觉的时候分泌物增多，产生的痰液储存在咽喉部，早晨起来活动后即可排出体外，排出的痰液经过晚上储存及浓缩可能会呈黄色。
另外，如果是细菌感染引起的痰液也可以是黄痰。因此，如果单纯早晨起来有黄痰白天没有，这种情况不用担心，多喝水可以慢慢缓解。
如果早晨起来及全天都有黄痰说明是细菌感染，也可能是支气管扩张或肺部感染所致，应该使用抗生素治疗，同时要根据痰液的来源，服用清咽利喉或止咳祛痰药物治疗。