早上肚子咕咕响的原因有以下几种：
1.饥饿。因为在夜间进食的食物经过一整夜的消化，一般在早上空腹的时候就会被消化完，此时处于空腹状态就会有饥饿的感觉。尤其是本身消化功能比较好，或者是前天晚上进食比较少，所以才会导致肠鸣音亢进，肚子有咕咕响的声音。
2.消化不良。如果夜间进食过多，食物不能够被很好地消化，会产生比较多的气体。胃内的气体增多的时候，也会出现咕咕响的情况，但是此时患者没有饥饿感。
3.肠道菌群紊乱。当有害菌明显增多的时候，肠道内菌群紊乱，就会导致气体的增多，引起咕咕响。
4.肠道的炎症。例如急性肠炎、溃疡性结肠炎等，会导致肠蠕动增快，出现肠鸣音的声音。