咽拭子取分泌物以后随时可以喝水，咽拭子不会造成咽喉部黏膜的损伤，取样后不影响正常进食。取样本时一般是从咽部或是扁桃腺部位取分泌物做细菌培养或是病毒分离，属于无创伤性的检查。
检查前尽量不要使用抗菌药物，避免影响检查的结果。如果检查结果中培养出致病菌或是病毒，则视为呼吸道感染，可以结合X光片，确定炎症的部位。
咽拭子检查目前广泛用于新冠病毒的筛查，如果咽拭子检查阳性，结合临床症状，及流行病学资料，可以确诊为新冠病毒感染。