男性尿道口疼痛有两种可能，分别为尿道口裂开和尿道口炎症，尿道口炎症更为常见。所以治疗上需要针对具体情况，给予对症治疗。
如果为尿道口炎症所致，可见尿道口皮肤红肿以及炎性分泌物。此时应予以敏感抗生素抗炎治疗，同时增加饮水量，增加排尿冲洗尿道促进炎症恢复，避免进食辛辣食物以免加重疼痛症状。
如果为尿道口裂开所致，可以由维生素缺乏导致皮肤皲裂。这种情况下需要补充维生素治疗，可逐渐好转。也可由外伤所致，这种情况常伴有出血，需要先予以止血处理，必要时予以清创缝合。这种情况下如疼痛明显，可给予适度止痛治疗。