前纵隔囊肿形成的原因大多是由于先天性发育异常所致。气管支气管囊肿是前纵隔先天性发育异常性囊肿中最常见的一种，大多数发生于受孕后第26至第40天，发生较早者多形成纵隔内肿物，大多数位于隆突周围，易因压迫邻近组织而引起临床症状。
食管囊肿来源于胚胎期前肠，为食管发育过程中未能形成正常管腔的结果。心包囊肿大多数为先天性疾病，一般呈梭形或卵圆形，壁菲薄，内含清亮的或草黄色的液体。
胸腺囊肿临床比较少见，可发生于从颈部到前纵隔的胸腺下降线的任何地方。